EDNA Plugin: EDPluginISPyBStoreAutoProcv1_3

Name:EDPluginISPyBStoreAutoProcv1_3
Project:mxPluginExec
Path:mxPluginExec/plugins/EDPluginGroupISPyB-v1.3/plugins/EDPluginISPyBStoreAutoProcv1_3.py
Author:Olof Svensson
Date:20120712
Copyright:European Synchrotron Radiation Facility, Grenoble, France
License:LGPLv3+
Module doc:
Class doc:Plugin to store results in an ISPyB database using web services
Datamodels: XSDataInputStoreAutoProc
targetNamespace "http://www.edna-site.org"

import XSDataCommon.XSDataDouble
import XSDataCommon.XSDataInteger
import XSDataCommon.XSDataImage
import XSDataCommon.XSData
import XSDataCommon.XSDataInput
import XSDataCommon.XSDataResult

complex type XSDataISPyBImageQualityIndicators extends XSData {
    binPopCutOffMethod2Res : XSDataDouble
    goodBraggCandidates : XSDataInteger
    iceRings : XSDataInteger
    image : XSDataImage
    inResTotal : XSDataInteger
    inResolutionOvrlSpots : XSDataInteger
    maxUnitCell : XSDataDouble
    method1Res : XSDataDouble
    method2Res : XSDataDouble
    pctSaturationTop50Peaks : XSDataDouble
    saturationRangeAverage : XSDataDouble optional
    saturationRangeMax : XSDataDouble optional
    saturationRangeMin : XSDataDouble optional
    signalRangeAverage : XSDataDouble optional
    signalRangeMax : XSDataDouble optional
    signalRangeMin : XSDataDouble optional
    spotTotal : XSDataInteger
    totalIntegratedSignal : XSDataDouble optional
}


complex type XSDataInputStoreImageQualityIndicators extends XSDataInput {
    imageQualityIndicators : XSDataISPyBImageQualityIndicators
}

complex type XSDataResultStoreImageQualityIndicators extends XSDataResult {
    imageQualityIndicatorsId : XSDataInteger
}

complex type XSDataInputStoreAutoProc extends XSDataInput {
    AutoProcContainer : AutoProcContainer
} 

complex type XSDataResultStoreAutoProc extends XSDataResult {
    autoProcId : XSDataInteger optional
} 


complex type AutoProc {
    spaceGroup : string
    refinedCell_a : string
    refinedCell_b : string
    refinedCell_c : string
    refinedCell_alpha : string
    refinedCell_beta : string
    refinedCell_gamma : string
}

complex type AutoProcScalingContainer {
    AutoProcScaling : AutoProcScaling
    AutoProcScalingStatistics : AutoProcScalingStatistics []
    AutoProcIntegrationContainer : AutoProcIntegrationContainer
}

complex type AutoProcScaling {
    recordTimeStamp : string
}

complex type AutoProcScalingStatistics {
    scalingStatisticsType : string
    comments : string
    resolutionLimitLow : float
    resolutionLimitHigh : float
    rMerge : float
    rmeasWithinIplusIminus : float
    rmeasAllIplusIminus : float
    rpimWithinIplusIminus : float
    rpimAllIplusIminus : float
    fractionalPartialBias : float
    nTotalObservations : float
    ntotalUniqueObservations : integer
    meanIOverSigI : float
    completeness : float
    multiplicity : float
    anomalousCompleteness : float
    anomalousMultiplicity : float
    anomalous : boolean
}

complex type Image {
    dataCollectionId : integer
}

complex type AutoProcIntegration {
    startImageNumber : integer
    endImageNumber : integer
    refinedDetectorDistance : float
    refinedXbeam : float
    refinedYbeam : float
    rotationAxisX : float
    rotationAxisY : float
    rotationAxisZ : float
    beamVectorX : float
    beamVectorY : float
    beamVectorZ : float
    cell_a : float
    cell_b : float
    cell_c : float
    cell_alpha : float
    cell_beta : float
    cell_gamma : float
    anomalous : boolean
}

complex type AutoProcIntegrationContainer {
    Image : Image
    AutoProcIntegration : AutoProcIntegration
}

complex type AutoProcProgram {
    processingCommandLine : string
    processingPrograms : string
    processingStatus : boolean
    processingMessage : string
    processingStartTime : string
    processingEndTime : string
    processingEnvironment : string
}

complex type AutoProcProgramAttachment {
    fileType : string
    fileName : string
    filePath : string
}

complex type AutoProcProgramContainer {
    AutoProcProgram : AutoProcProgram
    AutoProcProgramAttachment : AutoProcProgramAttachment []
}

complex type AutoProcContainer {
    AutoProc : AutoProc
    AutoProcScalingContainer : AutoProcScalingContainer
    AutoProcProgramContainer : AutoProcProgramContainer
}

complex type XSDataInputStoreDataCollection extends XSDataInput {
    dataCollection : XSDataISPyBDataCollection
}

complex type XSDataResultStoreDataCollection extends XSDataResult {
    dataCollectionId : XSDataInteger optional
}

complex type XSDataInputRetrieveDataCollection extends XSDataInput {
    image : XSDataImage
}

complex type XSDataResultRetrieveDataCollection extends XSDataResult {
    dataCollection : XSDataISPyBDataCollection
}

complex type XSDataISPyBDataCollection {
    dataCollectionId : integer
    blSampleId : integer
    sessionId : integer
    experimentType : string
    dataCollectionNumber : integer
    startDate : string
    endDate : string
    runStatus : string
    rotationAxis : string
    phiStart : float
    kappaStart : float
    omegaStart : float
    axisStart : float
    axisEnd : float
    axisRange : float
    overlap : float
    numberOfImages : integer
    startImageNumber : integer
    numberOfPasses : integer
    exposureTime : float
    imageDirectory : string
    imagePrefix : string
    imageSuffix : string
    fileTemplate : string
    wavelength : float
    resolution : float
    resolutionAtCorner : float
    detectorDistance : float
    detector2theta : float
    detectorMode : string
    undulatorGap1 : float
    undulatorGap2 : float
    undulatorGap3 : float
    xbeam : float
    ybeam : float
    crystalClass : string
    slitGapVertical : float
    slitGapHorizontal : float
    beamSizeAtSampleX : float
    beamSizeAtSampleY : float
    transmission : float
    synchrotronMode : string
    centeringMethod : string
    averageTemperature : float
    comments : string
    printableForReport : boolean
    xtalSnapshotFullPath1 : string
    xtalSnapshotFullPath2 : string
    xtalSnapshotFullPath3 : string
    xtalSnapshotFullPath4 : string
    beamShape : string
}