EDNA Plugin: EDPluginISPyBv1_1

Name:EDPluginISPyBv1_1
Project:mxPluginExec
Path:mxPluginExec/plugins/EDPluginGroupISPyB-v1.1/plugins/EDPluginISPyBv1_1.py
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Class doc:Plugin to store results in an ISPyB database using the DNA/ISPyB dbserver
Datamodels: XSDataInputISPyB
targetNamespace "http://www.edna-site.org"

import XSDataCommon.XSData
import XSDataCommon.XSDataBoolean
import XSDataCommon.XSDataDouble
import XSDataCommon.XSDataInput
import XSDataCommon.XSDataInteger
import XSDataCommon.XSDataResult
import XSDataCommon.XSDataString

complex type XSDataISPyBDataCollection extends XSData {
    dataCollectionId : XSDataInteger
    blSampleId : XSDataInteger
    sessionId : XSDataInteger
    experimentType : XSDataString
    dataCollectionNumber : XSDataInteger
    imageDirectory : XSDataString
    imagePrefix : XSDataString
}

complex type XSDataISPyBImage extends XSData {
    imageId : XSDataInteger
    imageNumber : XSDataInteger
    fileName : XSDataString
    fileLocation : XSDataString
    measuredIntensity : XSDataDouble
    jpegFileFullPath : XSDataString
    jpegThumbnailFileFullPath : XSDataString
    temperature : XSDataDouble
    cumulativeIntensity : XSDataDouble
    synchrotronCurrent : XSDataDouble
    comments : XSDataString
    machineMessage : XSDataString
}

complex type XSDataISPyBScreening extends XSData {
    screeningId : XSDataInteger
    dataCollectionId : XSDataInteger
    timeStamp : XSDataString
    programVersion : XSDataString
}

complex type XSDataISPyBScreeningInput extends XSData {
    screeningInputId : XSDataInteger
    screeningId : XSDataInteger
    beamX : XSDataDouble
    beamY : XSDataDouble
    rmsErrorLimits : XSDataDouble
    minimumFractionIndexed : XSDataDouble
    maximumFractionRejected : XSDataDouble
    minimumSignalToNoise : XSDataDouble
}

complex type XSDataISPyBScreeningInputContainer extends XSData {
    screeningInput : XSDataISPyBScreeningInput
}

complex type XSDataISPyBScreeningOutput extends XSData {
    screeningOutputId : XSDataInteger
    screeningId : XSDataInteger
    statusDescription : XSDataString
    rejectedReflections : XSDataInteger
    resolutionObtained : XSDataDouble
    spotDeviationR : XSDataDouble
    spotDeviationTheta : XSDataDouble
    beamShiftX : XSDataDouble
    beamShiftY : XSDataDouble
    numSpotsFound : XSDataInteger
    numSpotsUsed : XSDataInteger
    numSpotsRejected : XSDataInteger
    mosaicity : XSDataDouble
    iOverSigma : XSDataDouble
    diffractionRings : XSDataBoolean
    screeningSuccess : XSDataBoolean
    mosaicityEstimated : XSDataBoolean
}

complex type XSDataISPyBScreeningOutputContainer extends XSData {
    screeningOutput : XSDataISPyBScreeningOutput
    screeningOutputLattice : XSDataISPyBScreeningOutputLattice [] optional
    screeningStrategy : XSDataISPyBScreeningStrategy [] optional
}

complex type XSDataISPyBScreeningOutputLattice extends XSData {
    screeningOutputLatticeId : XSDataInteger
    screeningOutputId : XSDataInteger
    spaceGroup : XSDataString
    pointGroup : XSDataString
    bravaisLattice : XSDataString
    rawOrientationMatrix_a_x : XSDataDouble
    rawOrientationMatrix_a_y : XSDataDouble
    rawOrientationMatrix_a_z : XSDataDouble
    rawOrientationMatrix_b_x : XSDataDouble
    rawOrientationMatrix_b_y : XSDataDouble
    rawOrientationMatrix_b_z : XSDataDouble
    rawOrientationMatrix_c_x : XSDataDouble
    rawOrientationMatrix_c_y : XSDataDouble
    rawOrientationMatrix_c_z : XSDataDouble
    unitCell_a : XSDataDouble
    unitCell_b : XSDataDouble
    unitCell_c : XSDataDouble
    unitCell_alpha : XSDataDouble
    unitCell_beta : XSDataDouble
    unitCell_gamma : XSDataDouble
    timeStamp : XSDataDouble
}

complex type XSDataISPyBScreeningRank extends XSData {
    screeningRankId : XSDataInteger
    screeningRankSetId : XSDataInteger
    screeningId : XSDataInteger
    rankValue : XSDataDouble
    rankInformation : XSDataString
}

complex type XSDataISPyBScreeningRankSet extends XSData {
    screeningRankSetId : XSDataInteger
    rankEngine : XSDataString
    rankingProjectFileName : XSDataString
    rankingSummaryFileName : XSDataString
}

complex type XSDataISPyBScreeningStrategy extends XSData {
    screeningStrategyId : XSDataInteger
    screeningOutputId : XSDataInteger
    phiStart : XSDataDouble
    phiEnd : XSDataDouble
    rotation : XSDataDouble
    exposureTime : XSDataDouble
    resolution : XSDataDouble
    completeness : XSDataDouble
    multiplicity : XSDataDouble
    anomalous : XSDataBoolean
    program : XSDataString
    rankingResolution : XSDataDouble
    transmission : XSDataDouble
}

complex type XSDataInputISPyB extends XSDataInput {
    screening : XSDataISPyBScreening optional
    screeningInput : XSDataISPyBScreeningInput [] optional
    screeningOutputContainer : XSDataISPyBScreeningOutputContainer [] optional
    screeningRank : XSDataISPyBScreeningRank
    [] optional
    screeningRankSet : XSDataISPyBScreeningRankSet optional
    image : XSDataISPyBImage optional
}

complex type XSDataResultISPyB extends XSDataResult {
    dataCollectionId : XSDataInteger optional
    screeningStatus : XSDataResultStatus optional
    screeningInputStatus : XSDataResultStatus [] optional
    screeningOutputStatus : XSDataResultStatus [] optional
    screeningOutputLatticeStatus : XSDataResultStatus [] optional
    screeningRankStatus : XSDataResultStatus [] optional
    screeningRankSetStatus : XSDataResultStatus optional
    screeningStrategyStatus : XSDataResultStatus [] optional
}

complex type XSDataResultStatus extends XSData {
    id : XSDataInteger
    code : XSDataString
    message : XSDataString
}

complex type XSDatadbstatus extends XSData {
    screeningId : integer
    screeningInputId : integer
    screeningOutputId : integer
    screeningOutputLatticeId : integer
    screeningStrategyId : integer
    screeningRankId : integer
    screeningRankSetId : integer
    dataCollectionId : integer
    code : string
    message : string
}