EDNA Plugin: EDPluginMOSFLMIntegrationv10

Name:EDPluginMOSFLMIntegrationv10
Project:mxPluginExec
Path:mxPluginExec/plugins/EDPluginGroupMOSFLM-v1.0/plugins/EDPluginMOSFLMIntegrationv10.py
Author:Olof Svensson, Marie-Francoise Incardona, Karl Levik
Date:20120712
Copyright:European Synchrotron Radiation Facility, Grenoble, France
License:LGPLv3+
Module doc:
Class doc:
Datamodels: XSDataMOSFLMInputIntegration
targetNamespace "http://www.edna-site.org"

import XSDataCommon.XSData
import XSDataCommon.XSDataAngle
import XSDataCommon.XSDataDouble
import XSDataCommon.XSDataFile
import XSDataCommon.XSDataFloat
import XSDataCommon.XSDataImage
import XSDataCommon.XSDataInput
import XSDataCommon.XSDataInteger
import XSDataCommon.XSDataLength
import XSDataCommon.XSDataMatrixDouble
import XSDataCommon.XSDataResult
import XSDataCommon.XSDataString
import XSDataCommon.XSDataWavelength


complex type XSDataCell extends XSData {
    angle_alpha : XSDataAngle
    angle_beta : XSDataAngle
    angle_gamma : XSDataAngle
    length_a : XSDataLength
    length_b : XSDataLength
    length_c : XSDataLength
}

complex type XSDataMOSFLMBeamPosition extends XSData {
    x : XSDataLength
    y : XSDataLength
}

complex type XSDataMOSFLMDetector {
    numberPixelX : XSDataInteger
    numberPixelY : XSDataInteger
    pixelSizeX : XSDataLength
    pixelSizeY : XSDataLength
    ^type : XSDataString
}

complex type XSDataMOSFLMImage extends XSData {
    number : XSDataInteger
    rotationAxisEnd : XSDataAngle
    rotationAxisStart : XSDataAngle
}

complex type XSDataMOSFLMIndexingSolution extends XSData {
    cell : XSDataCell
    index : XSDataInteger
    lattice : XSDataString
    penalty : XSDataInteger
}

complex type XSDataMOSFLMInput extends XSDataInput {
    beam : XSDataMOSFLMBeamPosition
    detector : XSDataMOSFLMDetector
    directory : XSDataString
    distance : XSDataLength
    matrix : XSDataMOSFLMNewmat optional
    mosaicity : XSDataDouble optional
    symmetry : XSDataString optional
    template : XSDataString
    wavelength : XSDataWavelength
}

complex type XSDataMOSFLMInputGeneratePrediction extends XSDataMOSFLMInput {
    image : XSDataMOSFLMImage
}

complex type XSDataMOSFLMInputIndexing extends XSDataMOSFLMInput {
    image : XSDataMOSFLMImage []
}

complex type XSDataMOSFLMInputIntegration extends XSDataMOSFLMInput {
    imageEnd : XSDataInteger
    imageStart : XSDataInteger
    oscillationWidth : XSDataAngle
    rotationAxisStart : XSDataAngle
}

complex type XSDataMOSFLMInputPostRefinement extends XSDataMOSFLMInput {
}

complex type XSDataMOSFLMIntegrationStatistics extends XSData {
    averageIntensity : XSDataFloat
    averageIOverSigma : XSDataFloat
    averageSigma : XSDataFloat
    numberOfReflections : XSDataInteger
}

complex type XSDataMOSFLMIntegrationStatisticsPerReflectionType extends XSData {
    fullyRecorded : XSDataMOSFLMIntegrationStatistics
    partials : XSDataMOSFLMIntegrationStatistics
}

complex type XSDataMOSFLMIntegrationStatisticsPerResolutionBin extends XSData {
    maxResolution : XSDataFloat optional
    minResolution : XSDataFloat optional
    profileFitted : XSDataMOSFLMIntegrationStatisticsPerReflectionType
    summation : XSDataMOSFLMIntegrationStatisticsPerReflectionType
}

complex type XSDataMOSFLMMissettingsAngles extends XSData {
    phix : XSDataAngle
    phiy : XSDataAngle
    phiz : XSDataAngle
}

complex type XSDataMOSFLMNewmat extends XSData {
    aMatrix : XSDataMatrixDouble
    missettingAngles : XSDataMOSFLMMissettingsAngles
    refinedCell : XSDataCell
    uMatrix : XSDataMatrixDouble
}

complex type XSDataMOSFLMOutput extends XSDataResult {
    refinedBeam : XSDataMOSFLMBeamPosition optional
    refinedDistance : XSDataLength optional
    refinedNewmat : XSDataMOSFLMNewmat optional
    pathToLogFile : XSDataFile optional
}

complex type XSDataMOSFLMOutputGeneratePrediction extends XSData {
    predictionImage : XSDataImage
    pathToLogFile : XSDataFile optional    
}

complex type XSDataMOSFLMOutputIndexing extends XSDataMOSFLMOutput {
    beamShift : XSDataMOSFLMBeamPosition optional
    deviationAngular : XSDataAngle optional
    deviationPositional : XSDataLength optional
    mosaicityEstimation : XSDataFloat optional
    possibleSolutions : XSDataMOSFLMIndexingSolution [] optional
    selectedSolutionNumber : XSDataInteger optional
    selectedSolutionSpaceGroup : XSDataString optional
    selectedSolutionSpaceGroupNumber : XSDataInteger optional
    spotsTotal : XSDataInteger optional
    spotsUsed : XSDataInteger optional
}

complex type XSDataMOSFLMOutputIntegration extends XSDataMOSFLMOutput {
    bestfileDat : XSDataString
    bestfileHKL : XSDataString optional
    bestfilePar : XSDataString
    generatedMTZFile : XSDataFile
    highestResolutionIOverSigma : XSDataFloat
    numberOfBadReflections : XSDataInteger
    numberOfFullyRecordedReflections : XSDataInteger
    numberOfNegativeReflections : XSDataInteger
    numberOfOverlappedReflections : XSDataInteger
    numberOfPartialReflections : XSDataInteger
    numberOfReflectionsGenerated : XSDataInteger optional
    overallIOverSigma : XSDataFloat
    overallStatistics : XSDataMOSFLMIntegrationStatisticsPerResolutionBin
    refinedMosaicity : XSDataFloat optional
    refinedYScale : XSDataFloat
    RMSSpotDeviation : XSDataLength
    statisticsPerResolutionBin : XSDataMOSFLMIntegrationStatisticsPerResolutionBin []
}

complex type XSDataMOSFLMOutputPostRefinement extends XSDataMOSFLMOutput {
}